Тут тоже свои шаманства:
cygrunsrv.exe --install nginx -p c:\nginx\nginx.exe --neverexits -a "-p c:\nginx"
Ключ --neverexits нужен, т.к. nginx "форкается" (порождает отдельный процесс).
Ключ -a нужен что бы передать путь, где находится сам nginx. Иначе не найдет куда писать логи.
А вот прикрутить ротацию логов пока не получилось, ругается, что не может найти какой-то файл (смутно думаю, что пид-файл)
reload_logs.bat:
cd c:\nginx\logs\ ren access.log access-%DATE%.log ren error.log error-%DATE%.log cd .. nginx -s reopen
